员工劳动合同的赔偿标准是根据劳动者在单位工作年限来确定的。双方协商解除合同时，每满一年支付一个月工资的经济补偿，不满一年按一年计算，不满六个月支付半个月工资。单位无正当理由辞退时，需支付双倍赔偿金。合同解除前十二个月的平均工资作为月工资基准。违法解除合同或未签订书面合同，赔偿金为双倍工资。社会保险费必须缴纳到社保机构。劳动合同解除后需出具证明，并办理档案和社保关系转移手续。
法律分析
公司与员工劳动合同的赔偿标准是什么
1、如果双方协商一致解除合同，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算;不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。这里所称的月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，按应发工资计算。
2、如果单位没有正当合法理由单方辞退，需要按上面标准支付双倍的赔偿金。
3、企业首先提出同你解除劳动动合同应当给你按每工作一年支付一个月工资的标准支付补偿金(不足一年按一年计算，每六个月支付半个月工资，不足六个月按六个月计算。)
4、如果企业要么提前30天通知你解除劳动合同，要么给你预发一个月的工资。否则属于违法解除劳动合同;应当给你双倍(两个月工资)的经济赔偿。
5、企业应当赔给你补偿没有签订书面劳动合同的双倍工资(2008年1月1日起至2008年12月30日止，共12月的双倍工资差额)
6、社会保险费必须是缴纳到社会保险机构，包括企业和个人应缴部分;企业没有缴纳到社会保险机构是白发。你可以到劳动仲裁部门申请企业为你补缴所有未缴社会保险费用和险种。
7、月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资(包括)。
8、劳动合同法第五十条用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
9、劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。
10、《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。
结语
根据以上规定，公司与员工劳动合同的赔偿标准如下：双方协商一致解除合同时，按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付经济补偿。如果单位没有正当合法理由单方辞退，需要支付双倍的赔偿金。同时，劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资作为月工资的计算基础。劳动合同解除或终止时，用人单位应出具相应证明，并在十五日内办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应按约定办理工作交接，并在办结工作交接时支付经济补偿。根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条，月工资的计算包括计时工资或计件工资、奖金、津贴和补贴等货币性收入。
法律依据
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第四章 劳动合同的解除和终止 第三十七条 【劳动者提前通知解除劳动合同】劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第五章 特别规定 第二节 劳务派遣 第六十五条 【劳务派遣中解除劳动合同】被派遣劳动者可以依照本法第三十六条、第三十的规定与劳务派遣单位解除劳动合同。
被派遣劳动者有本法第三十九条和第四十条第一项、第二项规定情形的，用工单位可以将劳动者退回劳务派遣单位，劳务派遣单位依照本法有关规定，可以与劳动者解除劳动合同。
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第四章 劳动合同的解除和终止 第四十条 【无过失性辞退】有下列情形之一的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同：
（一）劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的；
（二）劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的；
（三）劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，经用人单位与劳动者协商，未能就变更劳动合同内容达成协议的。